Reduzierung von 50-Hz-Rauschen: "Wir sehen ein starkes 50-Hz-Artefakt in unseren Signalen – können Sie uns bei möglichen Erdungs- oder Abschirmungslösungen anleiten?"

Multi-Kamera-Sync-Setup: "Wir möchten, dass alle Kameras Zeitstempel teilen, damit wir Aufnahmen zuverlässig zusammenführen können – können Sie uns auf Best Practices hinweisen?"

Echtzeit-Datenprotokollierungs-Integration: "Wir brauchen ein System zur Integration von Echtzeit-Sensor-Logs – was wäre Ihr Ansatz?"

Vorverarbeitung von Calcium-Imaging-Daten: "Was sind die Best Practices für die Vorverarbeitung von Calcium-Imaging-Daten für die Bewegungskorrektur?"

Reproduzierbare Abbildungen (fUSI / Imaging): "Welche Schritte sind bei der Konvertierung von Matlab-Imaging-Code zu Python für reproduzierbare Abbildungen beteiligt?"

Prädiktive Modellierung von Verhalten: "Wie können wir ein prädiktives Modell aus Trial-Daten für Mausverhalten-Analyse erstellen?"

Vorverarbeitung von Calcium-Imaging-Daten: "Was sind die Best Practices für die Vorverarbeitung von Calcium-Imaging-Daten für die Bewegungskorrektur?"

Workshop: Umgang mit großen Imaging-Datensätzen: "Wir haben 200 GB an 2P-Imaging-Dateien – könnte Ihr Workshop uns Strategien zeigen, um sie auf einem normalen Computer zu handhaben?"

Modellierung periodischer neuraler Daten: "Welche alternativen statistischen Modelle können wir zur Analyse asymmetrischer periodischer Daten verwenden?"

Inception-Loop für MEI-Generierung: "Wie konstruieren wir eine Inception-Loop-Pipeline zur Generierung von MEIs aus neuralen Daten?"

Wald's-Test-Implementierung in R: "Können Sie bei der Fehlersuche einer R-Implementierung von Wald's Test für unseren Datensatz helfen?"

Organisation von Projektordnerstrukturen: "Unsere Dateistruktur ist chaotisch – können Sie uns bei einem Layout helfen, das für aktuelle und zukünftige Mitarbeiter funktioniert?"

Metadaten-Vorlagen für Rohdaten: "Wir benötigen Metadaten für unsere Aufnahmen, wissen aber nicht, wo wir anfangen sollen – können Sie uns bei einer minimalen Vorlage helfen?"

Vorbereitung auf Datenveröffentlichung: "Wir werden bald einen Artikel einreichen – können Sie uns durch die Datenveröffentlichung führen, damit sie die Zeitschriftenanforderungen erfüllt?"

Auswahl einer Lizenz für Code und Daten: "Wir sind uns nicht sicher, wie wir unseren Code und unsere Daten lizenzieren sollen – können Sie uns bei der Auswahl von etwas Offenem aber Angemessenem helfen?"

NWB-Dateistandardisierung: "Wir möchten NWB einführen, sind uns aber nicht sicher, wie wir mit unseren benutzerdefinierten Metadaten umgehen – können Sie uns einen Konvertierungsansatz zeigen?"

Inkrementelle Datenzusammenführung: "Wir haben eine Master-CSV, bekommen aber täglich neue Aufnahmen – wie können wir Zusammenführungen optimieren, um Duplikate zu vermeiden?"

Automatisierter Dokumentationsaufbau: "Wir hätten gern klickbare Dokumentation für jede Funktion – können Sie einen schnellen Ansatz empfehlen, um diese automatisch aus Docstrings zu generieren?"

Reproduzierbare Abbildungen sicherstellen: "Wir haben Random Seeds an verschiedenen Stellen – wie vereinheitlichen wir sie, damit die Abbildungsausgaben von Lauf zu Lauf reproduzierbar sind?"

Auto-Archivierung finaler Ergebnisse: "Wir vergessen ständig, finale Ergebnisse zu sichern – können wir einen automatischen Push zu unserer Datenfreigabe nach jedem erfolgreichen Lauf automatisieren?"

Protokollierung von Bewegungskorrektur-Metriken: "Gibt es eine Möglichkeit, Ausrichtungsstatistiken pro Lauf zu speichern, damit wir wissen, ob die Bilder zu stark driften?"

Versionskontrolle für CaImAn-Refaktorierung: "Wir haben CaImAn für unsere Pipeline modifiziert – wie verfolgen wir Änderungen, während wir offizielle Updates ziehen?"

Vorbereitung für ein reproduzierbares Paper: "Wir werden bald einreichen; können Sie uns bei der Finalisierung unseres Methodencodes helfen und sicherstellen, dass alles reibungslos neu läuft?"

DOIs für finale Datensätze zuweisen: "Wie können wir unsere finalen Ergebnisse mit einem DOI veröffentlichen, damit Leute sie direkt zitieren können?"

Reproduzierbare Analyse mit Zeitstempeln: "Wir möchten sicherstellen, dass andere unsere Ergebnisse wiederholen können, selbst wenn einige Schritte Stunden dauern – was ist die beste Praxis?"

Entwurf einer README für die Veröffentlichung: "Wir sind bereit, unsere Daten zu veröffentlichen, wissen aber nicht, was in die README aufgenommen werden soll – können Sie uns bei einem Entwurf helfen?"

Versionierung von Zwischen-Datensätzen: "Wir verarbeiten unsere Daten alle paar Wochen neu – wie können wir Änderungen strukturiert verfolgen, ohne alles zu überschreiben?"

Zuordnung von Roh- zu Finaldaten: "Wie verfolgen wir, welche Rohdatei welche finale Abbildung generiert hat, wenn mehrere Vorverarbeitungsskripte beteiligt sind?"

Einrichtung einer Labor-Datenrichtlinie: "Wir möchten eine Grundrichtlinie, damit alle im Labor Daten konsistent handhaben – können Sie uns beim Schreiben helfen?"

Automatisierung von Datenintegritätsprüfungen: "Wie können wir sicherstellen, dass unsere hochgeladenen Datensätze sich nicht stillschweigend geändert haben oder im Laufe der Zeit beschädigt wurden?"

Verknüpfung von Code mit spezifischen Datensätzen: "Unser Code funktioniert nur mit bestimmten Datenversionen – wie machen wir das offensichtlich und reproduzierbar?"

Postdoc-Übergabe-Checkliste: "Ich gehe bald – können Sie mir helfen sicherzustellen, dass alles für die nächste Person bereit ist?"

Modularisierung einer Matlab-Toolbox: "Wir haben ein riesiges Skript mit allem darin – wie können wir dies in logische Module mit klaren Ein- und Ausgaben aufteilen?"

Conda-Umgebungen für Reproduzierbarkeit: "Verschiedene Maschinen liefern verschiedene Ergebnisse – können Sie uns helfen, unsere Python-Umgebung über Systeme hinweg einzufrieren?"

Unit-Testing in R mit `testthat`: "Wir möchten vermeiden, alte Bugs wieder einzuführen – wie beginnen wir mit dem Hinzufügen grundlegender Tests in unserer R-Codebasis?"

Profiling von langsamem Python-Code: "Unser Code läuft, aber er ist unglaublich langsam – können Sie uns helfen herauszufinden, was ihn ausbremst?"

Zusammenführung geforkerter Codebasen: "Wir haben drei verschiedene Forks mit widersprüchlichen Änderungen – können Sie uns bei einer Merge-Strategie und Testabdeckung anleiten?"

Testen einer Klassifikations-Bibliothek: "Wir haben ein 2k-Zeilen-Skript ohne Tests – können Sie uns zeigen, wie wir modularisieren und pytest einführen?"

Inscopix-Datenextraktion: ""

Migration von Matlab zu Python: "Wir möchten zu Python wechseln – können Sie uns helfen, unsere Matlab-Codebasis zu übersetzen und Ersatz für Built-ins zu finden?"

Container-Registry-Einrichtung: "Wir möchten Container-Versionen verfolgen, damit verschiedene Projekte konsistente Umgebungen ziehen können – wie machen wir das?"

Debugging von Index-Fehlern in R: "Wir bekommen ständig NA-bezogene Fehler beim Umformen unserer Daten – können Sie uns beim Durchgehen des Bugs helfen?"

Lokale Parallelverarbeitung: "Unser Skript beansprucht eine CPU – können wir Aufgaben parallel spawnen oder joblib verwenden, damit es schneller fertig wird?"

Eins-zu-eins Debug-Coaching: "Manchmal haben wir Array-Out-of-Bounds – können wir einen kurzen Screen-Share machen, damit Sie sehen können, wie wir die Daten indizieren?"

Dockerisierung einer Python-2.7-Analyse: "Wir verwenden weiterhin Python 2.7 – können Sie uns helfen, es in Docker zu verpacken, damit andere es auf modernen Systemen ausführen können?"

Automatische QA-Prüfungen: "Wir hätten gern einen nächtlichen Job, um verdächtige Läufe zu kennzeichnen – gibt es einen einfachen Ansatz zur automatischen Prüfung der Datenintegrität?"

Property-Based Testing für Datei-Parser: "Unser Datei-Parser liest manchmal die letzten Bytes falsch – wie testen wir Edge-Cases systematisch?"

Parallele Beschleunigungen auf dem Desktop: "Können wir diese Schleifen über Kerne auf einem normalen PC verteilen, oder brauchen wir dafür einen Cluster?"

Überarbeitung der Dateinamengebung: "Wir haben alte Experimentdaten mit 'Run1', 'Exp3_1' usw. gekennzeichnet – wie können wir sie konsistent reorganisieren?"

Verpackung einer Python-Toolbox: "Wir möchten, dass Mitarbeiter einfach 'pip install' für unseren Code verwenden können – können Sie uns bei den Verpackungsschritten helfen?"

Verwendung von Git für Matlab-Projekte: "Wir haben Git nie zuvor verwendet – können Sie uns zeigen, wie wir Änderungen in unserem Matlab-Projekt verfolgen?"

Code-Reviews für Studentenprojekte: "Kann jemand unsere Skripte auf Lesbarkeit und Struktur prüfen, bevor wir sie abgeben?"

Verwendung von Virtualenv in Python: "Meine Pakete kollidieren ständig – wie kann ich sie pro Projekt isolieren?"

Matlab-Funktions-Refaktorierung: "Wir duplizieren ständig Code und bearbeiten Pfade manuell – können Sie uns beim Aufräumen helfen?"

Einführung in Python-Klassendesign: "Unser Skript ist zu lang – können wir Klassen verwenden, um es aufzuräumen?"

Automatisierte Dokumentation in R: "Wir vergessen, was unsere Funktionen tun – können wir Dokumentation automatisch aus Kommentaren generieren?"

Verpackung von Matlab-Code zum Teilen: "Wie teilen wir unser Matlab-Tool, ohne dass Leute ein Dutzend Dateien von Hand kopieren müssen?"

Jupyter-Notebooks als Lehrwerkzeuge: "Wir möchten Jupyter verwenden, um Analyse-Workflows zu unterrichten – können Sie uns bei der Einrichtung für Interaktivität helfen?"

CI-Testing für eine Python-Pipeline: "Wir arbeiten gemeinsam an einem Repo – können Sie uns bei der Einrichtung automatischer Tests helfen, damit wir Fehler früh erkennen?"

Skript-Vorlagen für neue Experimente: "Jedes Projekt beginnt von vorn – können Sie uns helfen, wiederverwendbare Skript-Vorlagen zu erstellen?"

Wechsel zu VSCode von Matlab-IDE: "Wir probieren VSCode aus – wie richten wir es sowohl für Matlab als auch für Python ein?"

Crashkurs: R-Markdown-Berichte: "Können Sie uns zeigen, wie wir PDFs aus unserem R-Code mit eingebetteten Plots und Inline-Ergebnissen erstellen?"

MATLAB-zu-Python-Konvertierung: "Wir verlassen uns auf älteren MATLAB-Code für finale Plots – wie replizieren wir diese in Python für ein Open-Source-Release?"

Ausführliche Code-Reviews: "Wir hätten gern eine zweite Meinung zur Code-Klarheit – können Sie eine Überprüfung unserer Hauptanalysefunktion durchführen?"

Übersetzung in ein neues Framework: "Wir haben unser eigenes Skript jahrelang verwendet – können Sie uns durch eine gut gepflegte Bibliothek zum Sortieren von Spikes führen?"

Vereinheitlichung von Daten-Scripting-Ansätzen: "Wir codieren alle unterschiedlich – können Sie eine Sitzung leiten, die zeigt, wie man ein typisches Dataset-Cleanup-Skript strukturiert?"