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Forschungsdatenmanagement

Unterstützung bei der Organisation, Dokumentation, Lizenzierung und gemeinsamen Nutzung von Daten während des gesamten Forschungslebenszyklus – von den ersten Rohdateien bis zu veröffentlichten Repositorien.

21 Projektbeispiele
5 Forschungsphasen abgedeckt
Neurowissenschaftsfokussierte Lösungen
Unmittelbare Wirkung
Forschungsdatenmanagement

Projektbeispiele Datenmanagement

Reale Herausforderungen und kollaborative Lösungen aus neurowissenschaftlichen Forschungslaboren. Jedes Projekt demonstriert gezielte Expertise in der Praxis.

Covering all research stages:   Data Acquisition Publication Data Processing Data Analysis Community Building

Organisation von Projektordnerstrukturen
Data Acquisition

Unterstützung bei der Umstrukturierung von Analyse- und Datenordnern mit konsistenten Konventionen zur Verbesserung der Klarheit und Übergabefähigkeit.

Metadaten-Vorlagen für Rohdaten
Data Acquisition

Entwicklung einer wiederverwendbaren Tabellenvorlage zur Dokumentation von Aufnahmeparametern und Probandeninformationen, später konvertiert zu JSON-Sidecars.

Vorbereitung auf Datenveröffentlichung
Publication

Unterstützung einer Gruppe bei der Auswahl eines geeigneten Repositoriums, Bereinigung der Ordnerstruktur und Hinzufügung einer README-Datei vor dem Upload.

Auswahl einer Lizenz für Code und Daten
Publication

Beratung zu geeigneten Open-Lizenzen für Datensätze, Analyseskripte und abgeleitete Ausgaben in einer Multi-Labor-Kollaboration.

NWB-Dateistandardisierung
Data Processing

Ein Nutzer wollte ältere proprietäre Rohdaten in das NWB-Format konvertieren, um eine breitere Datenaustausch-Compliance zu erreichen.

Inkrementelle Datenzusammenführung
Data Acquisition

Ein Team benötigte ein Skript, um täglich neue Aufnahmen zu einem bestehenden Master-Datensatz hinzuzufügen, ohne alte Daten neu zu verarbeiten.

Automatisierter Dokumentationsaufbau
Publication

Einrichtung von Sphinx oder MkDocs, damit Docstrings in einen gehosteten Referenzleitfaden transformiert werden.

Reproduzierbare Abbildungen sicherstellen
Publication

Ein Nutzer hatte finale Abbildungen aus mehreren Ad-hoc-Skripten erstellt und wünschte eine einzige Pipeline mit konsistentem Seeding.

Auto-Archivierung finaler Ergebnisse
Publication

Eine Gruppe benötigte ein Skript, das nach Abschluss der Analyse finale Daten komprimiert und mit einer Remote-Freigabe synchronisiert.

Protokollierung von Bewegungskorrektur-Metriken
Data Analysis

Eine Pipeline, die Korrekturmetriken (Verschiebung, Korrelation) protokolliert, sodass ein Forscher schnell sehen kann, ob Daten Qualitätsschwellen erfüllen.

Versionskontrolle für CaImAn-Refaktorierung
Data Processing

Ein Nutzer integrierte benutzerdefinierte Änderungen in CaImAn und benötigte stabile Versionskontrolle und Code-Review.

Vorbereitung für ein reproduzierbares Paper
Publication

Beratung eines Forschers, wie finale Notebooks gesammelt, Bibliotheksversionen eingefroren und ein teilbares Code-Release produziert werden.

DOIs für finale Datensätze zuweisen
Publication

Anleitung eines Nutzers durch den Upload zu Zenodo und das Anhängen eines DOI an ihre Analyseausgaben, um zitierbare Versionen sicherzustellen.

Reproduzierbare Analyse mit Zeitstempeln
Data Processing

Beratung einer Gruppe, alle wichtigen Läufe mit Zeitstempeln und Seed-Werten zu taggen und Zwischenergebnisse mit Git LFS zu speichern.

Entwurf einer README für die Veröffentlichung
Publication

Unterstützung eines Studenten beim Schreiben einer einfachen README, um ihre Daten und Code zu begleiten, einschließlich Kontaktinfo und Nutzungshinweise.

Versionierung von Zwischen-Datensätzen
Data Processing

Demonstration für ein Team, wie versionierte Ordner und Änderungsprotokolle strukturiert werden, während sich ihre Analyse im Laufe der Zeit entwickelt.

Zuordnung von Roh- zu Finaldaten
Data Analysis

Unterstützung eines Teams beim Erstellen einer Manifest-Datei, um zu verfolgen, wie Roheingaben auf jeden bereinigten Datensatz und jede finale Abbildung abgebildet wurden.

Einrichtung einer Labor-Datenrichtlinie
Community Building

Unterstützung eines PI beim Entwurf interner Richtlinien zur Datenspeicherung, Namenskonventionen und Projektarchivierung.

Automatisierung von Datenintegritätsprüfungen
Publication

Entwicklung eines Skripts zur Berechnung und Protokollierung von Prüfsummen für Schlüsseldateien vor dem Upload, zum Schutz vor stiller Korruption.

Verknüpfung von Code mit spezifischen Datensätzen
Data Processing

Unterstützung eines Teams bei der Umstrukturierung ihres Repositoriums, um die Analyse-Pipeline versioniert und datensatzspezifisch mit klaren Referenzen zu machen.

Postdoc-Übergabe-Checkliste
Data Analysis

Zusammenarbeit mit einem ausscheidenden Forscher, um ihre Datensätze, Skripte und Notizen für eine reibungslose Projektübergabe zu verpacken.

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Warum Datenmanagement Aufmerksamkeit verdient

Forschungsdatenmanagement wird oft als nachträglicher Gedanke behandelt – etwas, worüber man sich Sorgen macht, wenn man sich auf eine Veröffentlichung vorbereitet oder wenn ein Gutachter unangenehme Fragen zur Reproduzierbarkeit stellt. Aber Datenmanagement-Entscheidungen, die früh im Lebenszyklus eines Projekts getroffen werden, haben kumulative Effekte. Schlechte Entscheidungen über Organisation, Dokumentation und Metadaten erzeugen Reibung jedes Mal, wenn jemand mit den Daten interagiert: Mitarbeiter haben Schwierigkeiten, Dateistrukturen zu verstehen, Studenten verbringen Tage damit, kryptische Dateinamen zu entschlüsseln, und sechs Monate später kann sich selbst der ursprüngliche Forscher nicht mehr daran erinnern, welche Vorverarbeitungsversion welche Ergebnisse generiert hat.

Gutes Datenmanagement geht nicht um Bürokratie oder Overhead. Es geht darum, Forschung effizienter, zuverlässiger und nachhaltiger zu machen. Wenn Daten gut organisiert, ordnungsgemäß dokumentiert und durchdacht verwaltet werden, wird alles nachgelagerte einfacher: Analysen sind reproduzierbar, Kollaborationen verlaufen reibungsloser, Laborübergänge sind weniger schmerzhaft und Veröffentlichungsanforderungen fühlen sich handhabbar statt belastend an.

Was Forschungsdatenmanagement bedeutet

Forschungsdatenmanagement umfasst den vollständigen Lebenszyklus von Daten in einem Forschungsprojekt – vom Moment, in dem Rohdateien von Instrumenten eintreffen, über Vorverarbeitung, Analyse, Austausch bis zur langfristigen Aufbewahrung. Jede Phase beinhaltet Entscheidungen, die nicht nur die unmittelbare Bequemlichkeit, sondern langfristige Reproduzierbarkeit, Zusammenarbeit und wissenschaftliche Integrität beeinflussen.

Wir bieten praktische Unterstützung für Forschungsdatenmanagement über diesen Lebenszyklus hinweg:

Organisation und Struktur: Eine gut gestaltete Ordnerstruktur und konsistente Namenskonventionen mögen trivial erscheinen, sind aber grundlegende Infrastruktur. Wir helfen Gruppen, organisatorische Muster zu etablieren, die über Projekte hinweg skalieren, sich entwickelnden Anforderungen gerecht werden und für Neuankömmlinge verständlich bleiben. Dies umfasst das Design von Verzeichnishierarchien, die Forschungsabläufe widerspiegeln, die Etablierung von Namenskonventionen, die wesentliche Metadaten erfassen, und die Erstellung von Vorlagen, die Konsistenz ohne Starrheit gewährleisten.

Metadaten und Dokumentation: Rohdatendateien sprechen selten für sich selbst. Was waren die Aufnahmeparameter? Welche Version der Verarbeitungs-Pipeline wurde verwendet? Was bedeuten diese Spaltenüberschriften eigentlich? Wir helfen Gruppen, Metadaten-Praktiken zu implementieren, die für ihren Forschungskontext geeignet sind – sei es strukturierte Tabellenvorlagen, JSON-Sidecars für Bilddaten oder umfassende README-Dateien. Das Ziel ist es, kritische Informationen zu erfassen, wenn sie frisch sind, nicht zu versuchen, sie Monate später zu rekonstruieren.

Versionskontrolle und Provenienz: Forschungsdatensätze entwickeln sich. Rohdaten werden vorverarbeitet, Zwischenergebnisse werden verfeinert, Analysen werden aktualisiert. Diese Evolution zu verfolgen – welche Datenversion in welche Analyse einfloss, wie sich aktuelle Ergebnisse von früheren unterscheiden – ist für die Reproduzierbarkeit wesentlich. Wir helfen, Versionierungspraktiken und Provenienz-Tracking zu etablieren, die die Datenentwicklung transparent machen, ohne überwältigend zu werden.

Reproduzierbarkeit und Integrität: Reproduzierbare Forschung erfordert mehr als das Teilen finaler Daten – sie erfordert sicherzustellen, dass Daten-Pipelines dokumentiert sind, Zwischenschritte erhalten bleiben und der Weg von Rohdaten zu veröffentlichten Abbildungen nachvollziehbar ist. Wir helfen Gruppen, Praktiken zu implementieren, die Reproduzierbarkeit erreichbar machen: Einfrieren von Random Seeds, Dokumentation von Softwareversionen, Erhaltung von Zwischenergebnissen, Berechnung von Prüfsummen zur Erkennung von Korruption und Verknüpfung von Code mit spezifischen Datenversionen.

Austausch und Veröffentlichung: Forschungsdaten müssen zunehmend geteilt werden – für Zeitschriftenanforderungen, Förderungsauflagen oder wissenschaftliche Best Practices. Aber Daten gut zu teilen erfordert mehr als Dateien in ein Repositorium hochzuladen. Wir helfen Gruppen, Datensätze für die Veröffentlichung vorzubereiten: Bereinigung von Ordnerstrukturen, Auswahl geeigneter Repositorien und Lizenzen, Schreiben umfassender Dokumentation, Zuweisung von DOIs und Sicherstellung, dass veröffentlichte Datensätze sowohl technische Anforderungen (FAIR-Prinzipien) als auch praktische Nutzbarkeit erfüllen.

Labor-Richtlinien und Übergänge: Nachhaltiges Datenmanagement erfordert gruppenweite Praktiken, nicht nur individuelle gute Absichten. Wir helfen Forschungsgruppen, laborweite Richtlinien für Datenspeicherung, Organisation und Archivierung zu etablieren – Richtlinien, die Konsistenz über Projekte hinweg gewährleisten und Übergänge reibungsloser machen, wenn Studenten ihren Abschluss machen oder Postdocs weitergehen.

Warum externe Datenmanagement-Unterstützung hilft

Forschungsgruppen haben selten Datenmanagement-Expertise im Personal. PIs haben Forschung oft in einer Ära gelernt, als Datenmanagement das Ablegen von Ausdrucken bedeutete, und Studenten lernen Praktiken informell, indem sie kopieren, was frühere Labormitglieder taten (egal ob diese Praktiken gut waren oder nicht). Währenddessen verlangen Förderagenturen und Zeitschriften zunehmend formale Datenmanagementpläne und öffentlichen Datenaustausch, bieten aber wenig praktische Anleitung für die Umsetzung.

Jemanden zu haben, der sich auf Forschungsdatenmanagement spezialisiert – der sowohl die praktischen Realitäten von Forschungsabläufen als auch die Anforderungen moderner Reproduzierbarkeitsstandards versteht – kann Gruppen helfen, nachhaltige Praktiken ohne überwältigende Störung zu implementieren. Wichtiger noch, kollaboratives Arbeiten bedeutet, dass Ihr Team Prinzipien und Praktiken lernt, die es auf zukünftige Projekte anwenden kann, nicht nur Hilfe bei einer einmaligen Bereinigung erhält.

Unser Ansatz betont Pragmatismus über Perfektion. Wir sind nicht hier, um komplexe Datenbanksysteme aufzuzwingen oder auf Enterprise-Datenmanagement-Tools zu bestehen, die nicht in Forschungskontexte passen. Wir konzentrieren uns auf leichtgewichtige, wartbare Praktiken, die Ihrer Wissenschaft dienen – Verbesserung der Organisation, Erfassung wesentlicher Metadaten und Gewährleistung der Reproduzierbarkeit ohne bürokratischen Overhead zu schaffen, der die Forschung verlangsamt.

Datenmanagement als Forschungsinfrastruktur

Gut verwaltete Daten sind ein langfristiges Asset. Anfängliche Investitionen in Organisation, Dokumentation und Metadaten-Praktiken zahlen sich über den gesamten Projektlebenszyklus aus: Analysen sind zuverlässiger, Kollaborationen sind einfacher, Laborübergänge sind reibungsloser und Veröffentlichung wird unkompliziert statt eines Last-Minute-Kampfes, um zu rekonstruieren, was vor Monaten geschah.

Wir glauben, dass Forschungsgruppen profitieren, wenn Datenmanagement als wesentliche Infrastruktur statt als optionale Haushaltsführung behandelt wird. Ob Sie eine unordentliche Projektordnerstruktur organisieren, Datensätze für die Veröffentlichung vorbereiten, laborweite Datenrichtlinien implementieren oder einfach versuchen sicherzustellen, dass Ihre Daten in sechs Monaten noch Sinn ergeben – wir sind hier, um Ihre Forschungsdaten organisierter, dokumentierter und letztlich nützlicher für den Fortschritt der Wissenschaft zu machen.

Lassen Sie uns zusammenarbeiten!

Nicholas A. Del Grosso
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